在过去的 25 年中，基质辅助激光解吸电离 ( MALDI ) 质谱已发展成为一种功能强大、用途广泛的技术，具有多种的应用。MALDI 与飞行时间质谱 ( MALDI-TOF MS ) 的联用，可在一天中进行数千种生化分析，用于蛋白质测序、绘制组织中的生物分子谱图、微生物鉴定等。
MALDI-TOF MS 分析的样品通过混合或涂覆可吸收激光能量的基质溶液来进行样品制备，该溶液在干燥时可将样品包覆并共同结晶。基质通过激光束照射电离，并将电荷转移到分析物上，分析物产生单电荷的离子，然后被加速。离子根据其质荷比 ( m/z ) 的差异得以区分，并在 TOF 检测器得到检测。
MALDI-TOF MS 的高通量和速度，使其成为大规模蛋白质组学、成像研究和其它分析的重要工具。